امام خمینی در پانزدهم فروردین سال ۶۲ در حکمی به آیت الله سید علی خامنه ای، رئیس جمهور وقت، ماموریت دادند تا کلیه اقدامات لازم برای تمشیت امور ارتش و سپاه را انجام دهند.
به گزارش خبرنگار جی پلاس، امام خمینی (س) در تاریخ پانزدهم فروردین ۱۳۶۲، آیت الله سید علی خامنه ای را که آن زمان در کسوت رئیس جمهوری بودند، طی حکمی مأمور ایجاد هماهنگی امور ارتش و سپاه پاسداران قرار دادند. متن حکم امام به شرح زیر است:
"بسمه تعالی
جناب حجت الاسلام آقای حاج سید علی خامنه ای رئیس محترم جمهوری اسلامی ـ دامت افاضاته
نظر به نقش مؤثر و مهم نیروهای مسلح جمهوری در دفاع از کشور و جمهوری اسلامی و لزوم اهتمام و اشراف هر چه بیشتر و همه جانبه بر آنها، و با توجه به تعهد و بصیرت و علاقۀ جنابعالی به امور این نیروها، به آن جناب مأموریت می دهم که از طرف اینجانب کلیۀ اقدامات لازم را برای تمشیت امور ارتش و سپاه انجام داده و اهم امور را به اینجانب گزارش دهید.[1] انشاءاللّه تعالی موفق و مؤید باشید.
تاریخ 15 فروردین 1362
روح اللّه الموسوی الخمینی"
باز هم در این زمینه بخوانید:
حکمی که امام به آیت الله خامنه ای داد
در نامه امام به دانش آموزان دبستانی چه آمده بود؟
موضوع حکم امام به داریوش فروهر چه بود؟
علت اختلاف بین روحانیون که موجب نامه نگاری امام به آیت الله یزدی شد، چه بود؟
روزی که حجت الاسلام کروبی مامور اجرای حکم امام شد/ محتوای حکم چه بود؟
موضوع نامه امام به مهندس موسوی چه بود؟
احکامی که امام در ۲۳ اسفند صادر کردند
1 ـ به موجب اختیارات و وظایف رهبری، مندرج در اصل 110 قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران، فرماندهی کل قوا و نظارت عالیه بر امور نیروهای مسلح بر عهدۀ رهبر جمهوری اسلامی است.